La réserve de Nosy Mangabe est située au nord de la baie d’Antongil, à environ 5km du littoral au sud de Maroantsetra avec une superficie de 520 ha.
Le socle de l’île est constitué par du granite de l’Antongil et se trouve dans une enclave basaltique. Le terrain est accidenté, composé de pentes abruptes et de fréquents affleurements rocheux. On trouve de nombreux cours d’eau permanents. La pluviométrie dans la région de Nosy Mangabe est inférieure à celle enregistrée à Maroantsetra (4m env.)

L’île est couverte d’une forêt sempervirente humide de basse altitude. Il y a deux siècle , une grande déforestation aurait affecté l’île. La hauteur de la canopée atteint 35m sur les sols profonds. Les genres typiques sont le Canarium, Octea, Raventsara, et Tambourissa. Plus en altitude, les fougères épiphytes sont communes.

La diversité des espèces de Nosy Mangabe est réduite , mais compte tenu de son insularité, les Reptiles y sont particulièrement abondants. On compte parmi ceux – ci l’Uroplatus fimbriatus et Brookesia peyrierasi. La colubridé Pseudoxyrhopus heterurus a été recensé trois fois sur l’île qui constitue la seule localité connue.
39 espèces d’oiseaux ont été répertorié sur l’île parmi lesquels Glaréole pond ses œufs sur les rochers granitiques du bord de mer. A noter l’existence d’une héronnière abritant sur les îlots situés au Sud du Nosy Mangabe, 7 espèces de hérons (parmi lesquels Ardeola idae).
Les lémuriens sont représentés par le Lémur fauve (Lemur fulvus albifrons) le grand Cheirogale (Cheirogalus major), le Microcèbe roux (Microbus rifus) ainsi que par deux espèces introduites, le Lémur vari (Varecia variegata) dans les années 1930 et l’Aye Aye ( Daubentonia madagascariensis) en 1966.