Le parc se trouve dans la province d’Antsiranana , chevauchant la région de Sambava et celle d’Andapa s’étendant sur 60 150 ha
Auparavant, la réserve qui engloba le massif de Marojejy et les contreforts environnants changea de statut après le passage du botaniste français, le professeur Henri Humbert qui le qualifia de « massif le plus prestigieux de l’île entière à la fois par son aspect grandiose, par sa richesse floristique et, surtout par son caractère de nature inviolé (...) »et devient donc le Parc National de Marojejy en 1998.
Le massif est granitique et se compose de trois zones principales , qui s’élèvent en formant des sommets pointus et des arêtes de quartzite.

 Le climat est tempéré à froid et humide avec une pluviométrie annuelle supérieure à 2000 mm avec les plus grosses pluies en Novembre Décembre . Températures assez basses en hiver sur les sommets (à peine au-dessus de 0° C ) .

Forêt sempervirente humide (jusqu’à environ 800-900 m d’altitude) , forêt dense humide de montagne (de 800 à 1500 m d’altitude environ), forêt dense sclérophylle de montagne (vers 1400 m jusque vers 1800 m d’altitude) et fourré de montagne au delà de 1800m d’altitude.
La Marojejy est la seule grande montagne de Madagascar où le fourré de montagne est intact, ceux de Tsaratanàna et d’Andohahela ayant été endommagés récemment par des feux accidentels, celui de l’Ankaratra a disparu.

17 amphibiens et 22 reptiles ont été recensés dans le massif : 5 espèces de Brookesia et 7 de Chamaeleo parmi les caméléons qui sont trés nombreux à basse altitude .
Il existe 102 espèces d’oiseaux parmi lesquelles Mesitornis unicolor, Neodrepanis hyposantha et semble-t-il Eutriorchis astur (à verrifier)
Les lémuriens sont également nombreux dans cette forêt : 23 espèces recensées dont Propithécus diadema candidus à la fourrure entièrement blanche, les tenrecidae et carnivores connus sont peu nombreux dans le parc.