Localisée dans le Sud Est de l’île de Nosy Be , la Réserve Nationale Intégrale de Lokobe constitue la seule zone forestière originelle qui subsiste sur l’île de Nosy Be. Elle est située sur des roches éruptives de quaternaire qui se présentent sous la forme d’appareils volcaniques bien conservés. Le relief est constitué de collines de faible altitude (point culminant à 430m) débouchant pourtant brutalement dans la mer dans la partie Sud et Ouest de la réserve. On distingue à proximité de la réserve deux sites historiques importants. Le premier est le site de Marodokany , ancien village de commerçants indiens dont l’installation remonte au XVIIIè siècle. Ceux –ci ont exercé leur activité dans le domaine d’exploitation forestière et dans la commercialisation de la cire d’abeille, du miel et du copal (resine de copalier Trachylobium verrucosum --Leguminosae). Ce village et son cimetière sont à l’abandon depuis 1900. Le deuxième site est constitué par la grotte qui abrite le tombeau d’un roi Sakalava du Boina située dans la forêt de Besahonjo.

Le climat est de type tropical humide avec une pluviométrie annuelle moyenne de 2250mm, avec un maximum de précipitation durant les mois de Janvier et février. La saison sèche de Juin à Août est assez bien marquée. La température annuelle moyenne est de 26°C (min 15°C et max 34,8°C)

Le type forestier est proche de celui que l’on rencontre dans la réserve spéciale de Manongarivo (Domaine du Sambirano). Certaines parties de la réserve ont été exploitées au cours du XIXè siècle et ceci jusqu’en 1934. La forêt a néanmoins repris ses droits et la hauteur moyenne de la canopée avoisine 30m.
La strate arborescente est dominée par le Canarium Madagascariense – Burseraceae dont les plus beaux specimens atteignent 35m et 115cmde diamètre.
Le Potameia crassifolia – Lauraceae atteint lui jusqu’à 40m de hauteur

Mise à part l’herpétofaune qui est d’une grande richesse (30 espèces) , la faune est dans son ensemble assez pauvre . Seulement 4 espèces de mammifères ont été recensées parmi lesquels deux espèces communes de primates, le Lemur Macaco et le Lepilemur dorsalis. On a rapporté jusqu’en 1945 l’existence du Lemur Mongoz, mais il semble qu’il ait depuis disparu. La Réserve compte 17espèces d’oiseaux dont le Martin chasseur malgache (Ispidina madagascariensis) et le Hibou de Madagascar (Asio Madagascariensis).